Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms