Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPAP49450 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPAP49450 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms