Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK8P49336 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK8P49336 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK8P49336 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK8P49336 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms