Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA4P43694 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA4P43694 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA4P43694 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA4P43694 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATA4P43694 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms