Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms