Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP6P35125 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP6P35125 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP6P35125 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP6P35125 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP6P35125 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP6P35125 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP6P35125 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP6P35125 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP6P35125 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP6P35125 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP6P35125 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms