Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP1P29466 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP1P29466 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP1P29466 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP1P29466 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms