Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms