Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCP25054 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCP25054 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCP25054 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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