Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms