Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSP20132 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSP20132 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSP20132 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDSP20132 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDSP20132 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDSP20132 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDSP20132 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms