Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD46P15529 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD46P15529 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD46P15529 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms