Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms