Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODC1P11926 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms