Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMC1P11047 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms