Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGA3P0DJD8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms