Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD1P0DJD0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms