Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms