Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL2A1P02458 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms