Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-AP01891 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms