Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MSCO60682 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSCO60682 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MSCO60682 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSCO60682 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSCO60682 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSCO60682 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSCO60682 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSCO60682 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSCO60682 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSCO60682 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSCO60682 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSCO60682 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms