Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms