Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DENRO43583 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DENRO43583 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms