Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L18D6R9N7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L18D6R9N7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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