Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L11C9JVI0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L11C9JVI0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms