Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms