Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ISM1B1AKI9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms