Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC169A6NNP5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms