Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms