Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCNX2A6NKB5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms