Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSDA5PKW4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms