Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM89A2RUT3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM89A2RUT3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms