Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPSLA2A3N6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPSLA2A3N6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPSLA2A3N6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPSLA2A3N6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms