Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0D9SFI3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0D9SFI3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms