Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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FOXQ1Q9C009 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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