Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRNQ16849 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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