Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRRQ15256 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRRQ15256 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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