Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ODF1Q14990 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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ODF1Q14990 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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ODF1Q14990 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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ODF1Q14990 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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ODF1Q14990 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ODF1Q14990 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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