| PIN1 | Q13526 | RNU6-397P-201 | ENST00000516226 | 104 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORA40.15-201 | ENST00000516884 | 107 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC124657.1-201 | ENST00000527819 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AP002001.1-203 | ENST00000534002 | 267 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC092138.2-201 | ENST00000563811 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR1254-2-201 | ENST00000579553 | 63 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC006023.1-201 | ENST00000603944 | 259 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC004467.1-201 | ENST00000615678 | 330 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | 5S_rRNA.11-201 | ENST00000618635 | 84 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR6075-201 | ENST00000620782 | 95 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC091932.3-201 | ENST00000624223 | 323 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR3651-201 | ENST00000630427 | 90 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU1-51P-201 | ENST00000365345 | 176 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR606-201 | ENST00000384851 | 96 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | RN7SKP27-201 | ENST00000410684 | 333 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC016909.1-201 | ENST00000415916 | 166 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | LINC00407-201 | ENST00000426509 | 295 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC069540.2-201 | ENST00000441776 | 351 nt | TSL 3 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | YWHAEP4-201 | ENST00000505390 | 198 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | SCARNA13-201 | ENST00000516672 | 275 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU4ATAC17P-201 | ENST00000517272 | 120 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR3200-201 | ENST00000580767 | 85 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | RAC1P9-201 | ENST00000604990 | 392 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | PART1_1.1-201 | ENST00000611761 | 217 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U1.36-201 | ENST00000620684 | 176 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC096644.4-201 | ENST00000563417 | 2912 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | TTC6-201 | ENST00000267368 | 1681 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR515-2-201 | ENST00000384883 | 83 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR515-1-201 | ENST00000384884 | 83 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORA48.5-201 | ENST00000391143 | 135 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL159163.1-201 | ENST00000507747 | 600 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | TRAPPC2P7-201 | ENST00000509650 | 231 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC131281.1-201 | ENST00000522984 | 164 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MSMB-202 | ENST00000582163 | 488 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | SCOC-AS1-203 | ENST00000609616 | 405 nt | TSL 3 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.15-201 | ENST00000611544 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL021879.1-201 | ENST00000611756 | 288 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.16-201 | ENST00000613119 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.12-201 | ENST00000613778 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.20-201 | ENST00000613956 | 192 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.9-201 | ENST00000615427 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.11-201 | ENST00000616345 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.2-201 | ENST00000616535 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.3-201 | ENST00000617785 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | DLEU1_1.1-201 | ENST00000618107 | 190 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.19-201 | ENST00000618602 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU2-1-201 | ENST00000618664 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.6-201 | ENST00000619225 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.5-201 | ENST00000619465 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | U2.10-201 | ENST00000620268 | 191 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC006435.5-201 | ENST00000624486 | 112 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | CENPE-201 | ENST00000265148 | 8612 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | MCMDC2-207 | ENST00000492775 | 1831 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | XRCC4-205 | ENST00000511817 | 1636 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | TCF12-203 | ENST00000343827 | 3956 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.570-201 | ENST00000384750 | 101 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL592431.2-201 | ENST00000422198 | 171 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | DPH3P2-201 | ENST00000422618 | 250 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL513185.1-201 | ENST00000431638 | 162 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC073910.1-201 | ENST00000445047 | 438 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC010598.1-201 | ENST00000510378 | 103 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORA74D-201 | ENST00000516404 | 141 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC113192.4-201 | ENST00000534666 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | FAR1-204 | ENST00000532502 | 5820 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC007336.1-201 | ENST00000576365 | 3828 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.143-201 | ENST00000363520 | 106 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-271P-201 | ENST00000363858 | 105 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.183-201 | ENST00000363882 | 113 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU1-96P-201 | ENST00000364163 | 162 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-1175P-201 | ENST00000365200 | 107 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-21P-201 | ENST00000384710 | 107 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORA11-201 | ENST00000408789 | 128 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU2-54P-201 | ENST00000410299 | 190 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-130P-201 | ENST00000411112 | 103 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC078851.1-201 | ENST00000415918 | 298 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | CST2P1-201 | ENST00000425770 | 87 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC003988.1-201 | ENST00000447198 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL354733.1-201 | ENST00000458016 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RPL7P49-201 | ENST00000471402 | 708 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RPS27AP9-201 | ENST00000477681 | 438 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-155P-201 | ENST00000516347 | 100 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU7-110P-201 | ENST00000516891 | 62 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-1137P-201 | ENST00000517073 | 99 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL137100.2-201 | ENST00000555786 | 315 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC074050.1-201 | ENST00000563247 | 211 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AL353621.2-201 | ENST00000605340 | 133 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC011373.1-201 | ENST00000607270 | 237 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR376A1-201 | ENST00000616574 | 68 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC009487.2-201 | ENST00000420969 | 6821 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | ARHGAP5-202 | ENST00000345122 | 9604 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.210-201 | ENST00000364161 | 110 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RNU6-454P-201 | ENST00000364292 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | Y_RNA.276-201 | ENST00000364732 | 109 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORD63-201 | ENST00000384262 | 68 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | RPL23AP36-201 | ENST00000413895 | 458 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC113618.1-201 | ENST00000416747 | 285 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | AC005042.3-201 | ENST00000453230 | 174 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | SNORD65B-201 | ENST00000459126 | 73 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| PIN1 | Q13526 | MIR1302-2HG-201 | ENST00000469289 | 535 nt | TSL 5 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |