Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
MTSS1O43312 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MTSS1O43312 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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