Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
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