Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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