Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GEN1Q17RS7 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GEN1Q17RS7 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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