Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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