Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PKP1Q13835 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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