Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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