Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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