Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GPS1Q13098 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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GPS1Q13098 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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GPS1Q13098 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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GPS1Q13098 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GPS1Q13098 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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