Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN3Q13064 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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