Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RBBP4Q09028 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RBBP4Q09028 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms