Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA3O43365 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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